메타지노믹스를 이용한 환경 내 잠재적 병원성 미생물군집 프로파일링의 도전 과제

메타지노믹스는 환경 샘플 내 모든 미생물의 유전체를 직접 추출하여 분석하는 기술이지만, 실제 병원성 여부를 판단하기에는 여러 가지 난제가 존재한다.

분석적 한계와 대안

• 불완전한 분류 및 기능 해석: 시퀀싱된 리드들이 어떤 종에 속하며 어떤 기능을 수행하는지에 대한 완벽한 매핑이 어렵고, 이는 잠재적 위험 평가의 정확도를 낮춘다.
• 낮은 표현량의 희귀 병원균 검출 문제: 샘플 내 수가 매우 적은 특정 병원성 균주의 유전체 정보를 충분히 확보하기 어려워, 낮은 수준의 감염원을 놓칠 위험이 있다.

이러한 문제를 보완하기 위해 단순히 유전체 서열 분석에 머무르기보다, 단일세포 분석 기술을 활용하거나 특정 유전자를 타겟하는 qPCR 등의 방법을 병행하는 것이 현재 주요 대안으로 논의된다.