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์„ธํฌ ๋ฏธ์„ธํ™˜๊ฒฝ

์„ธํฌ ๋ฏธ์„ธํ™˜๊ฒฝ(Cellular Microenvironment)์€ ๊ฐœ๋ณ„ ์„ธํฌ๊ฐ€ ์กด์žฌํ•˜๋Š” ๊ตญ์†Œ์ ์ธ ๋ฌผ๋ฆฌ์ , ํ™”ํ•™์  ํ™˜๊ฒฝ์„ ์˜๋ฏธํ•˜๋ฉฐ, ์ด๋Š” ์„ธํฌ์˜ ๊ธฐ๋Šฅ, ๋ถ„ํ™”, ์ฆ์‹ ๋ฐ ์งˆ๋ณ‘ ๋ฐœ์ƒ์— ๊ฒฐ์ •์ ์ธ ์˜ํ–ฅ์„ ๋ฏธ์นฉ๋‹ˆ๋‹ค. ์ฃผ์š” ๊ตฌ์„ฑ ์š”์†Œ ์„ธํฌ์™ธ ๊ธฐ์งˆ(Extracellular Matrixโ€ฆ

1๊ฐœ์›” ์ „ 9 aginglab
๋‹จ์ผ์„ธํฌ ๊ณต๊ฐ„ ์ „์‚ฌ์ฒดํ•™์˜ ์ดˆ๊ธฐ ๋ฐœ์ „๊ณผ ๊ธฐ์ˆ ์  ์ง„ํ™”

๋‹จ์ผ์„ธํฌ ๊ณต๊ฐ„ ์ „์‚ฌ์ฒดํ•™์€ ๊ฐœ๋ณ„ ์„ธํฌ ์ˆ˜์ค€์—์„œ์˜ ์œ ์ „์ž ๋ฐœํ˜„ ์ •๋ณด๋ฅผ ์–ป์œผ๋ฉด์„œ๋„, ํ•ด๋‹น ์„ธํฌ๊ฐ€ ์›๋ž˜ ์†ํ–ˆ๋˜ ์„ธํฌ ๋ฏธ์„ธํ™˜๊ฒฝ ๋‚ด์˜ ๊ณต๊ฐ„์  ๋งฅ๋ฝ์„ ๋ณด์กดํ•˜๋Š” ํ˜์‹ ์ ์ธ ๊ธฐ์ˆ ๊ตฐ์ž…๋‹ˆ๋‹ค. ์ดˆ๊ธฐ ๊ฐœ๋… ์ •๋ฆฝ๋ถ€ํ„ฐ ํ˜„์žฌ๊นŒ์ง€ ์ตœ์ดˆ์—๋Š” ๋‹จ์ผ์„ธํฌ ๋ถ„์„์˜ ๋†’์€ ํ•ด์ƒ๋„๋ฅผ ๊ณต๊ฐ„ ์ •๋ณด์™€ ๊ฒฐํ•ฉํ•˜๋ ค๋Š” ์‹œ๋„๊ฐ€ โ€ฆ

1๊ฐœ์›” ์ „ 14 aginglab
๋‹จ์ผ์„ธํฌ ๊ณต๊ฐ„ ์ „์‚ฌ์ฒดํ•™ ๊ธฐ๋ฐ˜์˜ RNP ๋ณตํ•ฉ์ฒด ์„ธํฌ ์†Œ๊ธฐ๊ด€ ํŠน์ด์  ๊ตญ์†Œํ™” ๋ถ„์„ ๋ฐฉ๋ฒ•๋ก 

๋‹จ์ผ์„ธํฌ ๊ณต๊ฐ„ ์ „์‚ฌ์ฒดํ•™(Single-cell Spatial Transcriptomics)์€ ์กฐ์ง ๋‚ด ํŠน์ • ์„ธํฌ ์œ ํ˜•์˜ ์œ ์ „์ž ๋ฐœํ˜„ ์ •๋ณด๋ฅผ ๊ณต๊ฐ„์ ์œผ๋กœ ๋งคํ•‘ํ•˜๋ฉฐ, ์ด๋ฅผ ํ™•์žฅํ•˜์—ฌ ๋ฆฌ๋ณดํ•ต๋‹จ๋ฐฑ์งˆ(RNP) ๋ณตํ•ฉ์ฒด ์˜ ์„ธํฌ ๋‚ด ๊ตญ์†Œํ™” ํŠน์„ฑ์„ ์กฐ์‚ฌํ•˜๋Š” ์ฒจ๋‹จ ๋ถ„์„ ๋ฐฉ๋ฒ•๋ก ์ด๋‹ค. ๋ถ„์„ ๊ธฐโ€ฆ

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๊ด‘๋ฒ”์œ„ํ•œ ์œ ์ „์ž ๋ฐœํ˜„ ์กฐ์ ˆ ์‹œ์Šคํ…œ์˜ ์ฒด๊ณ„์  ํ•ด์„์„ ์œ„ํ•œ ํ†ตํ•ฉ ํ”Œ๋žซํผ ๊ตฌ์ถ• ์ „๋ง

ํ‘œ๊ด€์œ ์ „ํ•™ ์˜ ์‹ฌ์ธต์  ์ดํ•ด๋Š” ๋‹จ์ˆœํžˆ ๊ฐœ๋ณ„ ์œ ์ „์ž์˜ ๋ฐœํ˜„ ์ˆ˜์ค€ ์ธก์ •์—์„œ ๋ฒ—์–ด๋‚˜, ์„ธํฌ ์ „์ฒด์˜ ๋ณต์žกํ•œ ์œ ์ „์ž ์กฐ์ ˆ ๋„คํŠธ์›Œํฌ๋ฅผ ๊ฑฐ์‹œ์ ์œผ๋กœ ํ•ด์„ํ•˜๋Š” ๋ฐฉํ–ฅ์œผ๋กœ ์ง„ํ™”ํ•˜๊ณ  ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค. ๋ฏธ๋ž˜ ์ „๋ง๊ณผ ๋„์ „ ๊ณผ์ œ ์ฐจ์„ธ๋Œ€ ๊ธฐ์ˆ ( ๋‹จ์ผ์„ธํฌ ๋ถ„์„ , ๊ณต๊ฐ„ ์ „์‚ฌ์ฒดํ•™ )์˜ ์œตํ•ฉ์„ ํ†ตํ•ด ์‹œ๊ฐ„์ , ๊ณตโ€ฆ

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์ฝ”์ƒคํŽ˜๋ก 

์ฝ”์ƒคํŽ˜๋ก  ์ฝ”์ƒคํŽ˜๋ก (Chaperone)์€ ์„ธํฌ ๋‚ด์—์„œ ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ์˜ ์˜ฌ๋ฐ”๋ฅธ ์ ‘ํž˜(folding)๊ณผ ์•ˆ์ •์„ฑ์„ ์œ ์ง€ํ•˜๋„๋ก ๋•๋Š” ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ๊ตฐ์ด๋‹ค. ์ฃผ์š” ๊ธฐ๋Šฅ์€ ์ŠคํŠธ๋ ˆ์Šค ์กฐ๊ฑด ํ•˜์—์„œ ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ์˜ ๋ณ€์„ฑ(denaturation)์„ ๋ฐฉ์ง€ํ•˜๊ณ , ์ž˜๋ชป ์ ‘ํžŒ ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ์„ ์žฌ์ ‘ํž˜์‹œํ‚ค๊ฑฐ๋‚˜ ๋ถ„ํ•ด ๊ฒฝ๋กœ๋กœ ์œ ๋„ํ•˜โ€ฆ

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ํŠน์ • ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ ์ ‘ํž˜ ์ด์ƒ(Misfolding) ๊ด€๋ จ ์ƒคํŽ˜๋ก -์ฝ”์ƒคํŽ˜๋ก  ์‹œ์Šคํ…œ์˜ ์ง„ํ™”์  ์—ญํ•  ์—ฐ๊ตฌ

๋‹จ๋ฐฑ์งˆ ์ ‘ํž˜ ์ด์ƒ์€ ๋‹ค์–‘ํ•œ ์งˆ๋ณ‘์˜ ์ฃผ์š” ์›์ธ์ด ๋˜๋ฉฐ, ์ด๋ฅผ ๋ฐฉ์ง€ํ•˜๊ธฐ ์œ„ํ•ด ์„ธํฌ๋Š” ์ƒคํŽ˜๋ก  ๋ฐ ์ฝ”์ƒคํŽ˜๋ก  ์‹œ์Šคํ…œ์„ ํ†ตํ•ด ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ ํ•ญ์ƒ์„ฑ์„ ์œ ์ง€ํ•ฉ๋‹ˆ๋‹ค. ์ด๋“ค ์‹œ์Šคํ…œ์˜ ์ง„ํ™”์  ์—ญ์‚ฌ๋Š” ๊ทนํ•œ ํ™˜๊ฒฝ ์ ์‘ ๋ฐ ์ƒ๋ช… ํ˜„์ƒ์˜ ๋ณต์žก์„ฑ ์ฆ๊ฐ€์™€ ๋ฐ€์ ‘ํ•˜๊ฒŒ ์—ฐ๊ด€๋˜์–ด ์žˆ์Šต๋‹ˆ๋‹ค. ์ง„ํ™”์  ๋งฅ๋ฝ๊ณผ ํ•ต์‹ฌ ๋ฐœโ€ฆ

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RNA ๊ฒฐํ•ฉ ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ

RNA ๊ฒฐํ•ฉ ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ(RNA-binding proteins, RBPs)์€ ๋‹ค์–‘ํ•œ ์ข…๋ฅ˜์˜ ํ•ต์‚ฐ(์ฃผ๋กœ RNA )๊ณผ ํŠน์ด์ ์œผ๋กœ ์ƒํ˜ธ์ž‘์šฉํ•˜๋Š” ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ ๊ตฐ์ง‘์ด๋‹ค. ์ด๋“ค์€ ์œ ์ „์ž ๋ฐœํ˜„ ์กฐ์ ˆ, ์ „์‚ฌ ํ›„ ์กฐ์ ˆ, ์Šคํ”Œ๋ผ์ด์‹ฑ, mRNA ์•ˆ์ •์„ฑ ์œ ์ง€ ๋“ฑ ์„ธํฌ ๋‚ด ํ•„์ˆ˜์ ์ธ ์ƒ๋ฌผํ•™์  ๊ณผ์ •์— ๊ด€์—ฌโ€ฆ

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mRNA ๋ณ€ํ˜•์ฒด ํŒจํ„ด์„ ์ด์šฉํ•œ ์•” ์ง„ํ–‰ ๋‹จ๊ณ„๋ณ„ ์ƒ์ฒดํ‘œ์ง€์ž ๋ฐœ๊ตด์˜ ๋‚œ์ œ

mRNA ๋ณ€ํ˜•์ฒด (e.g., m6A, pseudouridine)์˜ ๋™์  ํŒจํ„ด ๋ณ€ํ™”๋Š” ์ •์ƒ ์„ธํฌ์™€ ์•…์„ฑ ์ข…์–‘ ๊ฐ„์˜ ํ‘œํ˜„ํ˜• ์ฐจ์ด๋ฅผ ๋ฐ˜์˜ํ•˜์ง€๋งŒ, ์ด๋Ÿฌํ•œ ๋ณ€ํ˜•์ฒด๊ฐ€ ์ž„์ƒ์ ์œผ๋กœ ์˜๋ฏธ ์žˆ๋Š” ๋ฐ”์ด์˜ค๋งˆ์ปค ๋กœ ํ™•๋ฆฝ๋˜๋Š” ๋ฐ์—๋Š” ์—ฌ๋Ÿฌ ํ•ด์„ํ•™์  ๋‚œ์ œ๊ฐ€ ์กด์žฌํ•œ๋‹ค. ์ตœ์‹  ์—ฐ๊ตฌ์˜ ๋”œ๋ ˆ๋งˆ ๋‹ค์ˆ˜์˜ iโ€ฆ

1๊ฐœ์›” ์ „ 8 aginglab
AI ๊ธฐ๋ฐ˜ ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ ๊ตฌ์กฐ ์˜ˆ์ธก์„ ํ™œ์šฉํ•œ ์‹ ์•ฝ ํ›„๋ณด ๋ฌผ์งˆ์˜ ๋ถ„์ž ๋„ํ‚น ์ตœ์ ํ™” ์ „๋žต

๋ณธ ์ฃผ์ œ๋Š” ์•ŒํŒŒํด๋“œ ์™€ ๊ฐ™์€ AI ๋ชจ๋ธ๋กœ ์˜ˆ์ธก๋œ ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ 3์ฐจ์› ๊ตฌ์กฐ ์ •๋ณด๋ฅผ ์ด์šฉํ•˜์—ฌ, ์ž ์žฌ์  ์‹ ์•ฝ ๊ฐœ๋ฐœ ํ›„๋ณด ๋ฌผ์งˆ๊ณผ์˜ ์ƒํ˜ธ์ž‘์šฉ์„ ์ •๋Ÿ‰์ ์œผ๋กœ ํ‰๊ฐ€ํ•˜๊ณ  ์ตœ์ ํ™”ํ•˜๋Š” ๋ฐฉ๋ฒ•๋ก ์„ ๋‹ค๋ฃน๋‹ˆ๋‹ค. ๊ตฌ์กฐ ๊ธฐ๋ฐ˜ ์•ฝ๋ฌผ ์žฌ์ฐฝ์ถœ AI ์˜ˆ์ธก ๊ตฌ์กฐ๋Š” ์ „ํ†ต์ ์ธ ์‹คํ—˜์  ๋ฐฉ๋ฒ•์„ ๋ณด์™„ํ•˜์—ฌ ํƒ€๊ฒŸ ๋‹จ๋ฐฑ์งˆ์˜ ๊ฒฐโ€ฆ

1๊ฐœ์›” ์ „ 7 aginglab
mRNA ๋ณ€์ด์ฒด ์ธ์‹ ๊ธฐ๋ฐ˜์˜ ์ฐจ์„ธ๋Œ€ ๋ฐฑ์‹  ํ•ญ์› ๋””์ž์ธ ์ „๋žต

๋ณธ ์ฃผ์ œ๋Š” ๊ธฐ์กด์˜ ์•ˆ์ •์ ์ธ ํ•ญ์›์— ๋จธ๋ฌด๋ฅด์ง€ ์•Š๊ณ , ๊ฐ์—ผ ๊ณผ์ •์—์„œ ๋‚˜ํƒ€๋‚˜๋Š” mRNA ์˜ ๋‹ค์–‘ํ•œ ๋ณ€์ด์ฒด(Variant)๋ฅผ ์˜ˆ์ธกํ•˜๊ณ  ์ด๋ฅผ ํ‘œ์ ์œผ๋กœ ํ•˜๋Š” ์ฐจ์„ธ๋Œ€ ๋ฐฑ์‹ ํ•™ ์ „๋žต์„ ๋‹ค๋ฃฌ๋‹ค. ํ•ญ์› ๋‹ค์–‘์„ฑ ์˜ˆ์ธก๊ณผ ํ”Œ๋žซํผ ์œตํ•ฉ ์œ ์ „์ฒดํ•™ ๊ณผ ์ƒ๋ฌผ์ •๋ณดํ•™ ์„ ์œตํ•ฉํ•˜์—ฌ ์ž ์žฌ์ ์ธ ๋ณ€์ด์ฒด์— ๋Œ€์‘ํ• โ€ฆ

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